Puskesmas Kalibawang terletak di Dusun Ngrajun, Desa Banjarharjo, Kecamatan Kalibawang.

Batas wilayah kecamatan Kalibawang meliputi :

1. Sebelah utara : Kecamatan Borobudur Kabupaten Magelang
2. Sebelah timur : Kecamatan Ngluwar Kabupaten Magelang
3. Sebelah selatan : Kecamatan Nanggulan Kabupaten Kulon Progo
4. Sebelah barat : Kecamatan Samigaluh Kabupaten Kulon Progo

Luas wilayah Puskesmas Kalibawang 53,96 Km², terdiri dari :

• Datar sampai berombak : 15%
• Berombak sampai berbukit : 20%
• Berbukit sampai bergunung : 65%

Pembagian desa, rukun warga (RW), dan rumah tangga (RT) Kecamatan Kalibawang sebagai berikut :

1. Banjararum, terdiri dari : 26 dusun, 52 RW, 104 RT
2. Banjarasri, terdiri dari : 16 dusun, 34 RW, 68 RT
3. Banjarharjo, terdiri dari : 22 dusun, 46 RW, 102 RT
4. Banjaroyo, terdiri dari : 19 dusun, 39 RW, 82 RT

Jarak Puskesmas ke wilayah kerja dan pusat pemerintahan adalah sebagai berikut :

1. Dusun terjauh : 15 km (60 menit)
2. Desa terjauh : 6,5 km (15 menit)
3. Ibukota Kabupaten : 37 km (60 menit)
4. Ibukota Propinsi : 40 km (75 menit)